MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020055	CAA	2	6	70	75	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020055	TCC	2	6	120	125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020055	TTA	2	6	190	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020055	TCC	2	6	201	206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020055	GTG	2	6	219	224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020055	TAA	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020055	AT	3	6	292	297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020055	A	7	7	313	319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020055	ACT	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020055	TGA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839710
11	NC_020055	A	7	7	381	387	100 %	0 %	0 %	0 %	436839710
12	NC_020055	GAA	3	9	470	478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
13	NC_020055	A	6	6	492	497	100 %	0 %	0 %	0 %	436839711
14	NC_020055	GAA	2	6	527	532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
15	NC_020055	AAAG	2	8	539	546	75 %	0 %	25 %	0 %	436839711
16	NC_020055	CTCAT	2	10	567	576	20 %	40 %	0 %	40 %	436839711
17	NC_020055	GCAG	2	8	581	588	25 %	0 %	50 %	25 %	436839711
18	NC_020055	T	6	6	610	615	0 %	100 %	0 %	0 %	436839711
19	NC_020055	AAT	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839711
20	NC_020055	GAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
21	NC_020055	T	6	6	692	697	0 %	100 %	0 %	0 %	436839711
22	NC_020055	ATA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020055	TA	3	6	774	779	50 %	50 %	0 %	0 %	436839712
24	NC_020055	GAC	2	6	788	793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
25	NC_020055	AGC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
26	NC_020055	CAG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
27	NC_020055	A	8	8	1182	1189	100 %	0 %	0 %	0 %	436839712
28	NC_020055	A	6	6	1238	1243	100 %	0 %	0 %	0 %	436839712
29	NC_020055	G	6	6	1308	1313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020055	CA	3	6	1333	1338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020055	TTCTT	2	10	1351	1360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020055	CT	3	6	1475	1480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020055	TTC	2	6	1500	1505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020055	ATT	2	6	1510	1515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020055	CCA	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839713
36	NC_020055	GAA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839713
37	NC_020055	GAA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839713
38	NC_020055	TGC	2	6	1701	1706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839713
39	NC_020055	GT	3	6	1733	1738	0 %	50 %	50 %	0 %	436839713
40	NC_020055	T	7	7	1738	1744	0 %	100 %	0 %	0 %	436839713
41	NC_020055	A	6	6	1768	1773	100 %	0 %	0 %	0 %	436839713
42	NC_020055	TAA	2	6	1935	1940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839713
43	NC_020055	ATC	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839713
44	NC_020055	C	9	9	1954	1962	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_020055	T	8	8	1964	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020055	ATT	2	6	1977	1982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020055	ATT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020055	TGA	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020055	G	6	6	2114	2119	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020055	T	6	6	2211	2216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020055	T	6	6	2286	2291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020055	TTC	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020055	CTT	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020055	TCT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020055	CAA	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020055	TCA	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020055	TTG	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020055	CTG	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020055	T	7	7	2505	2511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020055	TTAA	2	8	2621	2628	50 %	50 %	0 %	0 %	436839714
61	NC_020055	A	6	6	2635	2640	100 %	0 %	0 %	0 %	436839714
62	NC_020055	TAGG	2	8	2652	2659	25 %	25 %	50 %	0 %	436839714
63	NC_020055	GAATA	2	10	2687	2696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020055	GA	3	6	2813	2818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020055	GATTG	2	10	2845	2854	20 %	40 %	40 %	0 %	436839715
66	NC_020055	GAG	2	6	2893	2898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839715
67	NC_020055	TCCA	2	8	2916	2923	25 %	25 %	0 %	50 %	436839715
68	NC_020055	GTTA	2	8	2929	2936	25 %	50 %	25 %	0 %	436839715
69	NC_020055	TTCA	2	8	2958	2965	25 %	50 %	0 %	25 %	436839715
70	NC_020055	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
71	NC_020055	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
72	NC_020055	A	8	8	3105	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	436839716
73	NC_020055	TGT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839716
74	NC_020055	A	7	7	3181	3187	100 %	0 %	0 %	0 %	436839716
75	NC_020055	ATT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839716
76	NC_020055	TGA	3	9	3306	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
77	NC_020055	TGA	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
78	NC_020055	GAAA	2	8	3468	3475	75 %	0 %	25 %	0 %	436839716
79	NC_020055	GAA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
80	NC_020055	AAG	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
81	NC_020055	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839716
82	NC_020055	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
83	NC_020055	AGA	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
84	NC_020055	A	7	7	3863	3869	100 %	0 %	0 %	0 %	436839716
85	NC_020055	AGC	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
86	NC_020055	ATG	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
87	NC_020055	CAT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839716
88	NC_020055	TTCAG	2	10	4147	4156	20 %	40 %	20 %	20 %	436839716
89	NC_020055	AAC	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
90	NC_020055	CTC	2	6	4262	4267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839716
91	NC_020055	TGA	2	6	4275	4280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
92	NC_020055	GAAT	2	8	4338	4345	50 %	25 %	25 %	0 %	436839716
93	NC_020055	TGA	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
94	NC_020055	A	6	6	4473	4478	100 %	0 %	0 %	0 %	436839716
95	NC_020055	AAT	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
96	NC_020055	GAT	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
97	NC_020055	A	6	6	4711	4716	100 %	0 %	0 %	0 %	436839716
98	NC_020055	GAT	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
99	NC_020055	CCAA	2	8	4803	4810	50 %	0 %	0 %	50 %	436839716
100	NC_020055	GAT	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
101	NC_020055	T	6	6	4858	4863	0 %	100 %	0 %	0 %	436839716
102	NC_020055	AAC	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
103	NC_020055	T	6	6	5014	5019	0 %	100 %	0 %	0 %	436839716
104	NC_020055	TGTC	2	8	5047	5054	0 %	50 %	25 %	25 %	436839716
105	NC_020055	CAA	2	6	5126	5131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
106	NC_020055	AAT	2	6	5179	5184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
107	NC_020055	ATTT	2	8	5203	5210	25 %	75 %	0 %	0 %	436839716
108	NC_020055	GAC	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
109	NC_020055	TTC	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839716
110	NC_020055	AGA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
111	NC_020055	AG	3	6	5407	5412	50 %	0 %	50 %	0 %	436839716
112	NC_020055	CAG	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
113	NC_020055	AC	3	6	5504	5509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020055	GGA	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839717
115	NC_020055	CTG	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839717
116	NC_020055	GAA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839717
117	NC_020055	CCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839717
118	NC_020055	GAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839717
119	NC_020055	CTTT	2	8	6000	6007	0 %	75 %	0 %	25 %	436839717
120	NC_020055	CTTT	2	8	6017	6024	0 %	75 %	0 %	25 %	436839717
121	NC_020055	GCA	2	6	6029	6034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839717
122	NC_020055	TCA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839717
123	NC_020055	A	6	6	6076	6081	100 %	0 %	0 %	0 %	436839717
124	NC_020055	T	6	6	6142	6147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020055	T	7	7	6167	6173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020055	GCA	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020055	GA	3	6	6234	6239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020055	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839718
129	NC_020055	T	7	7	6314	6320	0 %	100 %	0 %	0 %	436839718
130	NC_020055	CAA	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839718
131	NC_020055	TCC	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839718
132	NC_020055	ATCTA	2	10	6482	6491	40 %	40 %	0 %	20 %	436839718
133	NC_020055	AAAAT	2	10	6624	6633	80 %	20 %	0 %	0 %	436839718
134	NC_020055	GCC	2	6	6693	6698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839718
135	NC_020055	TCTG	2	8	6730	6737	0 %	50 %	25 %	25 %	436839718
136	NC_020055	GGAT	2	8	6837	6844	25 %	25 %	50 %	0 %	436839718
137	NC_020055	TTG	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839718
138	NC_020055	TCT	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839718
139	NC_020055	CCT	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839718
140	NC_020055	CCAGC	2	10	7092	7101	20 %	0 %	20 %	60 %	436839718
141	NC_020055	CCG	2	6	7169	7174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839718
142	NC_020055	GAAC	2	8	7223	7230	50 %	0 %	25 %	25 %	436839719
143	NC_020055	GCG	2	6	7255	7260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839719
144	NC_020055	TCC	2	6	7265	7270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839719
145	NC_020055	TCA	3	9	7301	7309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839719
146	NC_020055	GAC	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839719
147	NC_020055	AAG	2	6	7363	7368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839719
148	NC_020055	CTG	2	6	7381	7386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839719
149	NC_020055	CTGAT	2	10	7472	7481	20 %	40 %	20 %	20 %	436839719
150	NC_020055	CTT	2	6	7519	7524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839719
151	NC_020055	GCAA	2	8	7647	7654	50 %	0 %	25 %	25 %	436839720
152	NC_020055	GTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839720
153	NC_020055	CAC	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839720
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155	NC_020055	GCA	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839720
156	NC_020055	GCTTT	2	10	7939	7948	0 %	60 %	20 %	20 %	436839720
157	NC_020055	GGT	2	6	7977	7982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839720
158	NC_020055	AATTT	2	10	8025	8034	40 %	60 %	0 %	0 %	436839720
159	NC_020055	CTT	2	6	8048	8053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839720
160	NC_020055	T	6	6	8231	8236	0 %	100 %	0 %	0 %	436839720
161	NC_020055	T	6	6	8330	8335	0 %	100 %	0 %	0 %	436839720
162	NC_020055	TCA	2	6	8338	8343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839720
163	NC_020055	ATG	2	6	8366	8371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020055	GTC	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_020055	TACCT	2	10	8495	8504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_020055	A	8	8	8563	8570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020055	AAT	2	6	8576	8581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_020055	TCC	2	6	8648	8653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_020055	AGA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_020055	ATG	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_020055	GCC	2	6	8818	8823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_020055	GTG	2	6	8880	8885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020055	TGAAA	2	10	8888	8897	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_020055	TGATG	2	10	8942	8951	20 %	40 %	40 %	0 %	436839721
175	NC_020055	ACTC	2	8	8956	8963	25 %	25 %	0 %	50 %	436839721
176	NC_020055	GCA	2	6	9001	9006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839721
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178	NC_020055	ATT	2	6	9022	9027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839721
179	NC_020055	ACTT	2	8	9097	9104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_020055	TGTT	2	8	9203	9210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020055	GTT	2	6	9220	9225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_020055	TGATA	2	10	9258	9267	40 %	40 %	20 %	0 %	436839722
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185	NC_020055	GTG	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839722
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229	NC_020055	T	7	7	11288	11294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_020055	AATA	2	8	11308	11315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_020055	AT	3	6	11333	11338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_020055	ACC	2	6	11352	11357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
233	NC_020055	TAA	2	6	11405	11410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_020055	CAA	2	6	11438	11443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_020055	A	6	6	11442	11447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_020055	AAT	2	6	11451	11456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_020055	GTT	2	6	11464	11469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
238	NC_020055	TCCC	2	8	11501	11508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
239	NC_020055	T	6	6	11572	11577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_020055	T	6	6	11654	11659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_020055	GCAAA	2	10	11836	11845	60 %	0 %	20 %	20 %	436839726
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249	NC_020055	A	6	6	12045	12050	100 %	0 %	0 %	0 %	436839726
250	NC_020055	GACA	2	8	12051	12058	50 %	0 %	25 %	25 %	436839726
251	NC_020055	A	6	6	12342	12347	100 %	0 %	0 %	0 %	436839726
252	NC_020055	A	6	6	12362	12367	100 %	0 %	0 %	0 %	436839726
253	NC_020055	ATTG	2	8	12462	12469	25 %	50 %	25 %	0 %	436839726
254	NC_020055	CA	3	6	12539	12544	50 %	0 %	0 %	50 %	436839726
255	NC_020055	ATA	2	6	12586	12591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839726
256	NC_020055	AAGG	2	8	12618	12625	50 %	0 %	50 %	0 %	436839726
257	NC_020055	ACG	2	6	12659	12664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839726
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260	NC_020055	AAG	2	6	13143	13148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839727
261	NC_020055	ATG	3	9	13201	13209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839727
262	NC_020055	A	6	6	13230	13235	100 %	0 %	0 %	0 %	436839727
263	NC_020055	TTC	2	6	13263	13268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839727
264	NC_020055	CTT	2	6	13271	13276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839727
265	NC_020055	CAT	2	6	13293	13298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839727
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267	NC_020055	TTG	2	6	13369	13374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839727
268	NC_020055	AATA	2	8	13471	13478	75 %	25 %	0 %	0 %	436839727
269	NC_020055	A	7	7	13478	13484	100 %	0 %	0 %	0 %	436839727
270	NC_020055	AAG	2	6	13581	13586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839727
271	NC_020055	T	6	6	13605	13610	0 %	100 %	0 %	0 %	436839727
272	NC_020055	AATA	2	8	13635	13642	75 %	25 %	0 %	0 %	436839727
273	NC_020055	AAGTG	2	10	13664	13673	40 %	20 %	40 %	0 %	436839728
274	NC_020055	GTG	2	6	13714	13719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839728
275	NC_020055	GATA	2	8	13804	13811	50 %	25 %	25 %	0 %	436839728
276	NC_020055	CTG	2	6	13851	13856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839729
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